臨床醫生經常質疑，藥敏試驗報告敏感的藥物治療為什么沒有效？臨床想用的藥物為什么不做藥敏試驗？針對這些問題檢驗科醫師通常使用CLSI藥敏試驗相關規則進行解釋，如藥敏試驗值檢測可能有效的藥物，天然耐藥的藥物不進行藥敏試驗；只檢測預報藥和指示藥，而不是檢測所有藥；藥敏試驗所報告的藥物對感染菌治療效果不是同等的（有首選藥、次選藥、僅針對尿路感染的藥物、必須與其他藥物聯合使用藥物等）；針對同一種細菌不同的感染部位，抗菌藥物治療效果不同，如針對腦脊液中分離的細菌，一代、二代頭孢、大環內酯類抗菌藥物即使體外試驗敏感，抗菌藥物治療也無效。今天將細菌藥敏試驗規則，細菌耐藥趨勢和《國家抗微生物治療指南》結合，綜合解釋細菌感染經驗治療和目標性治療思路，以及葡萄球菌、鏈球菌、腸球菌、腸桿菌科細菌和非發酵菌等常見病原菌感染抗菌藥物選擇思路。
葡萄球菌耐藥特征，對于獲得性耐藥葡萄球菌，對萬古霉素的耐藥非常罕見，青霉素耐藥約占95%，社區獲得性感染中甲氧西林耐藥<10%，醫院獲得性感染葡萄球菌甲氧西林耐藥約有40%-80%，近年來有下降趨勢。葡萄球菌感染治療思路，非皮膚軟組織感染，首選苯唑西林，如果敏感，可加耐酶青霉素和一代頭孢；如果對苯唑西林耐藥，則看萬古霉素的藥敏結果，如果敏感，可選用萬古霉素、去甲萬古、替考拉寧和利奈唑胺；如果對萬古霉素耐藥，則考慮用利奈唑胺、達托霉素和替加環素。如果是皮膚軟組織感染葡萄球菌，首先進行清創處理，然后選用復方磺胺或大環內酯。
β-溶血性鏈球菌感染治療原則，陰道拭子β-溶血性鏈球菌培養陽性，問患者青霉素過敏史和做青霉素皮試，如果不過敏，可選用青霉素；如果皮試提示低風險，選用頭孢唑林；如果皮試提示高風險，做紅霉素、克林霉素藥敏和D試驗，克林霉素敏感用克林霉素，克林霉素耐藥則選用萬古霉素。
肺炎鏈球菌感染，如果青霉素藥敏敏感，首選青霉素和氨芐青霉素，如果是重癥或腦膜炎，選用頭孢曲松、美羅培南和萬古霉素；如果青霉素耐藥，可用氟喹諾酮類，大劑量頭孢曲松/頭孢噻肟，萬古霉素±利福平，亞胺培南，美羅培南。
腸球菌感染治療思路，非泌尿道感染時，如果青霉素和氨基糖苷藥敏都敏感，首選青霉素/氨芐青+氨基糖苷類藥物；如果青霉素敏感，而氨基糖苷耐藥，選用青霉素和氨芐青霉素藥物。如果青霉素和萬古霉素都耐藥，選用利奈唑胺、達托霉素和替加環素；如果青霉素耐藥萬古霉素敏感，可用萬古霉素、去甲萬古、替考拉寧和利奈唑胺。
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