我國湖泊治理思路正在發生改變，由治劣轉變為保優。從環保部今天發布的《水質較好湖泊生態環境保護總體規劃（2013-2020年）》（以下簡稱規劃）就可證明這一點。由環保部、發改委以及財政部制定的這一規劃明確提出，為保護湖泊生態環境，避免眾多湖泊再走“先污染、后治理”的老路，我國將對生態環境較好的湖泊進行保護。
自“九五”以來，國家對污染嚴重的太湖、巢湖、滇池（以下簡稱“三湖”）開展了大規模的治理工作，初步遏制了“三湖”水質惡化的趨勢。但是，“三湖”的治理效果并未完全達到理想狀態。
規劃透露，經國務院同意，自2011年開始，財政部和環保部支持水面面積在50平方公里（km2）及以上、具有飲用水水源功能或重要生態功能、現狀水質或目標水質好于Ⅲ類（含Ⅲ類）的湖泊開展生態環境保護工作。截至2013年底，中央財政累計投入40億元，分3批支持撫仙湖、千島湖、洱海等54個湖泊開展生態環境保護工作。經過治理，這些湖泊水質穩中改善，生態環境逐步恢復。
黑龍江省的鏡泊湖，吉林省的松花湖，浙江省的千島湖，云南省、四川省的瀘沽湖，貴州省紅楓-百花湖等不僅擁有優良的水質，而且大多也是著名的旅游區。據規劃介紹，包括這些湖泊在內仍然存在環境風險。
規劃表示，根據《2012年中國環境狀況公報》，小興凱湖、興凱湖、南四湖和陽澄湖等湖泊為輕度富營養狀態。同時，部分水質較好湖泊出現湖面萎縮現象，由于自然與人為原因導致紅堿淖水位急劇下降，水面面積已由最大時的100km2縮減到目前的67km2。
此外，還有部分湖泊水質不達標。規劃透露，2011年調查顯示，214個湖泊水庫型飲用水水源中有9個水質不達標。
“隨著湖泊流域人口增長和經濟發展，特別是近年來湖泊流域種養殖業、旅游業、采礦業以及沿湖工業和城鎮化的不斷發展，保護‘一湖清水’壓力越來越大。”規劃說，湖泊流域城鄉人口增長和沿湖區域城市化，加大了沿岸生活污染防治和湖濱帶生態保護壓力，部分城鎮生活污染處理基礎設施建設滯后；湖泊流域大量農業面源、農村生活污水直接入湖，尤其是網箱養殖等造成氮、磷等污染負荷不斷加大，富營養化趨勢上升，控源減排的任務十分艱巨。
規劃明確，水質較好湖泊保護將優先選擇水質較好、具有重要飲用水水源或重要生態功能的湖泊。而水面面積在50km2以上，現狀水質或目標水質好于Ⅲ類（含Ⅲ類），具有飲用水水源功能或重要生態功能的湖泊；水面面積在20-50 km2之間，現狀水質好于Ⅲ類（含Ⅲ類），具有飲用水水源功能的湖泊等都劃入了保護范圍，總共涉及365個湖泊。其中具有飲用水水源功能的181個，約占50%；地處國家級自然保護區或國家級風景名勝區的107個，約占29%。
三部委表示，我國將對水質較好湖泊劃分為5個自然分布區域進行保護，即東北湖區、東部湖區、云貴湖區、蒙新湖區和青藏湖區。
規劃要求，五區要調整湖泊流域產業結構和布局，關停和搬遷湖泊敏感區域污染企業，湖泊上游地區要優先發展無污染產業，合理布局湖泊流域內的工業園區。同時明確，各省級人民政府對湖泊生態環境保護工作負總責，湖泊所在市（縣）級人民政府負責湖泊保護工作的具體實施。
環保部將參照《重點流域水污染防治專項規劃實施情況考核暫行辦法》對規劃內湖泊水質保護目標進行考核。
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