近日,由哈爾濱醫科大學基因組中心主任劉樹林指導的科研小組,針對半封閉基因池模型提出了界定細菌物種的3Cs標準。該標準是用于細菌自然分類的真正意義上的客觀標準,可科學指導醫生的臨床診斷和治療,并可用于對以往細菌物種和待定細菌物種的判定。
有些醫生可能會困惑為什么有些腸沙門菌會引起胃腸炎但無需治療,而另一些卻可引起致命的傷寒病。有了3Cs標準,醫生的困惑就可迎刃而解了。按照3Cs標準,雖然胃腸炎和傷寒病均由腸沙門菌引起,但它們是由不同的細菌物種感染所致,如引起胃腸炎的是鼠傷寒沙門菌等細菌,而引起傷寒病的則是傷寒沙門菌。
3Cs標準具體內容為:同一物種的所有成員親緣關系密切、 近緣但是不同物種之間有清晰的遺傳邊界、同一物種的所有成員具有共同的生物學特性,而這些特征性的生物學特性不見于任何其他物種。因三條標準的英文表述都由字母C開頭,因此稱作3Cs標準。
起初細菌的物種主要根據細菌形態、生化反應、血清學試驗等表型性狀來界定。上世紀70年代起,人們把DNA雜交率>70%作為細菌物種的界限。1980年前后,美國科學家Carl Woese把16S rRNA序列相似度>97%作為細菌物種的界限。此后,這兩項指標成為定義細菌物種的金標準。但這兩項指標都是連續性的,其中70%和97%為人為硬性界定,缺乏可信服的科學依據。
此次提出的3Cs標準不但可明確界定細菌的物種,而且闡明了為什么如此界定。據悉,相關論文已被伯杰氏國際系統微生物學學會期刊接收,即將刊出。
(來源:健康報網)
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