中國科研人員采用比較基因組學方法,歷經6年多的努力,終于找到了引起傷寒病的沙門氏菌來自不同的直系祖先。
據哈爾濱醫科大學基因組中心主任劉樹林教授介紹,傷寒病是一種急性傳染病,需要及時治療,否則可危及生命。1881年,人類首次從傷寒病人身上分離到了傷寒沙門氏菌。后來,又陸續分離到甲型副傷寒沙門氏菌、乙型副傷寒沙門氏菌和丙型副傷寒沙門氏菌,并確定這四種不同的病菌都能引起傷寒病。
這四種病菌來自于共同祖先,還是各自獨立形成的?這個問題的澄清對研究傳染病致病因子的起源、進化和控制有著重要意義。
2002年,劉樹林教授帶領的課題組開始對丙型副傷寒沙門氏菌進行基因序列分析。他們利用上世紀90年代初建立起來的獨特方法,即高分辨率基因組物理圖構建技術,先制作了一幅基因組“略圖”,勾勒出了該細菌基因組的框架,然后在此基礎上進行序列的組裝。這種基因組“略圖”能夠表現基因組的大致形狀和基因之間的相互關系,大大降低了基因序列分析所需的成本。
利用這種方法,課題組對3種傷寒病致病菌所共有的3000多個保守基因進行比較,構建出了反映它們之間親緣關系的系統發育樹。
在劉樹林課題組構建的系統發育樹上,傷寒沙門氏菌和丙型副傷寒沙門氏菌居于樹枝的兩端,同時,丙型副傷寒沙門氏菌與豬霍亂沙門氏菌(不引起人的傷寒病)共居一枝的枝梢。
這些大量翔實的數據給出了清晰的結論:導致傷寒病的細菌,不是由共同的直接祖先進化而來,而是各自分別獲得了有關遺傳性狀最后發展成侵襲人體并造成傷寒病的特殊病原體。這一研究成果于今年2月份發表在國際著名期刊PLOSONE上。
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