生物修復（bioremediation）：利用生物將土壤、地表及地下水或海洋中的危險性污染物現場去除或降解的工程技術系統。
生物修復與生物處理是一致的，兩者的區別在于生物修復幾乎專指已被污染的土壤、地下水和海洋中有毒有害污染物的原位生物處理，旨在這些地方恢復“清潔”，而生物處理一般具有更廣泛的涵義。
可用作生物修復的微生物類型：1）土著微生物；2）外來微生物；3）基因工程菌。
3.4.1土壤生物修復的原位處理方式
這種方法是在受污染地區直接采用生物修復技術，不需要將土壤挖出和運輸。其基本方法是在修復區鉆井，一組是注水井，用來將接種的微生物、水、營養物和電子受體等物質注入土壤中；另一組是抽水井，通過抽取地下水，造成地下水在地層中流動，促進微生物的分布及營養物質的運輸。
例：生物通風系統
有機污染物會降低土壤中的氧氣濃度，增加二氧化碳濃度，進而抑制污染物進一步生物降解的條件。因此，生物通風系統向土壤中補充氧氣來提高土壤中的污染物降解效果。
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