盡管目前對益生素的作用機理還有不同的說法，還不是完全清楚，但至少應包括以下幾個方面。

    一是對病原菌的拮抗作用和對有益菌的促生作用使用益生素后，一方面加大了腸道內有益菌的比例，降低了有害菌的比例，另一方面，益生素所含的菌體對致病菌產生拮抗作用，使致病茵的生長受到抑制，絕對數量降低，正常菌群狀態得以恢復。這些拮抗作用體現在以下方面：（1）改變腸道環境，抑制有害菌生長，如臘樣芽抱桿菌有很強的耗氧能力，在作為益生素應用后可使腸道內形成缺氧環境，從而抑制了具有需氧特性的大多數病原菌的生長。乳酸菌作為益生素使用可提高腸內酸度，使嗜堿性病原微生物的生長受到抑制；（2）有些益生素的菌體可產生某種抗菌物質來抑制有害菌的生長；（3）益生菌可在腸道內與有害菌競爭營養素；（4）占據腸道的位置，阻止病原菌附著。

    二是提供某些營養素的作用。益生素菌體可為動物提供多種對其生長發育有益的物質，如維生素、氨基酸，淀粉酶、蛋白酶等消化酶類，以及其它促生長物質。

    三是刺激機體免疫功能的作用。含有活微生物的益生素可刺激動物腸道免疫系統細胞，提高局部免疫機能及抗病能力。腸道有益菌特別是乳酸菌對動物的免疫系統具有促進作用，對特異性的細胞和體液免疫以及非特異性免疫（吞噬和補體反應）都有重要作用。如仔豬乳酸桿菌能以某種免疫調節因子的形成刺激腸道局部型免疫反應，使機體的抗體水平和巨嗜細胞活性大大提高。即益生素可以作為抗原來產生相應抗體。反過來，免疫機能的增強對維持和促進腸內菌群數量又起著重要作用。

    由于益生素在促進動物健康與生長性能方面的有益作用，自 20 世紀 70 年代末，益生素受到業界的高度重視，研究不斷深入，應用也日益廣泛。特別是從 2006 年 1 月起歐盟禁止使用抗生素生長促進劑（AGP）后，進一步促進了益生素的應用，益生素已成為越來越受到畜牧業、飼料業和水產養殖業歡迎的產品。據預測，在未來的三至五年內，世界動物飼料的益生素市場可能會增加一倍。雖然益生素的好處得到了普遍的接受，但是，關于益生素的作用機制問題還有許多尚不清楚，一直是困擾著研究人員的一個研究課題。其原因在于，在進行的不同試驗中存在著巨大的變化，不僅涉及到受試驗動物及其所處的環境，而且還涉及到益生素制劑本身的不同。針對益生素應用效果及應用過程中出現的問題，目前，人們開始研究和探討如何更加合理有效地使用益生素，使之發揮其預期的效力。同時，人們也在開發和研究益生素與其他制劑間的聯合使用，如酶制劑、酸化劑、中草藥等，以充分利用各種制劑間的協同作用。總之，益生素正以其獨特的理念與功能日益影響著畜牧業的健康發展，而且隨著對益生素作用機制微生態學腸道粘膜免疫學等方面研究的不斷深入，以及人們綠色安全環保意識的不斷增強，益生素的應用前景會更加廣闊。

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