外植體的接種是把經過表面消毒后的植物材料切割或分離出器官、組織、細胞，轉移到培養基上的過程。整個接種均需在無菌條件下進行操作，一切用具、材料、培養基、接種環境等都需要無菌。

無菌操作質量的高低決定了組織培養的成敗，組培的工序中無菌操作的環節很多，材料切割、莖尖剝離、材料轉接、封口等各個環節均要求規范、準確、迅速，任何一步做不好就會導致失敗。

較大的材料肉眼觀察即可操作分離，較小的材料需要在解剖鏡下放大操作。分離工具要鋒利，切割動作要快，防止擠壓，避免使用生銹的刀片，以防止氧化現象產生。用滅菌過的器械，將切割好的外植體插植到培養基表面上。培養材料在培養容器內的分布要均勻，以保證必要的營養面積和光照條件。莖段基部插入固體培養基中，莖尖下端置于培養基表面，葉片通常將葉背接觸培養基，這是由于葉背氣孔多，利于吸收水分和養分的緣故。所有材料接種完畢，應做好標記，注明材料名稱、接種日期等。