1、高壓蒸汽滅菌
高壓蒸汽滅菌適合于耐高溫培養基、接種器械和蒸餾水的滅菌。培養基在愛制備過程中混入各種雜菌，分裝后應立即滅菌，至少應在24h內完成滅菌工作。滅菌時一般是在0.105MPa壓力下，溫度121℃時，滅菌15~30min即可。消毒時間不宜過長，也不能超過規定的壓力范圍，否則有機物質特別是維生素類物質就會在高溫下分解，失去營養作用，也會使培養基變質、變色，甚至難以凝固。
將蒸餾水或自來水裝在三角瓶中，裝水量一般不超過瓶的2/3，用牛皮紙或硫酸紙包扎封口，然后放入高壓鍋中滅菌后即為無菌水。
滅菌后的培養基可放到培養室中預培養3d，若無污染現象，則證明滅菌是徹底的，可以使用。暫時不用的培養基最好置于10℃下保存。含IAA或GA3的培養基應在1周內用完，其他培養基最多也不要超過1個月。
2、過濾滅菌
一些植物生長調節劑及有機物，如IAA、GA3、ZT、CM等，遇熱容易分解，不能與培養基一起進行高溫滅菌，而要使用細菌過濾器濾去其中的雜菌。細菌過濾器與濾膜（孔徑0.45微米）使用之前要先進行高壓滅菌。過濾后的溶液要立即加入培養基中，若為液體培養基，可在培養基冷卻至30℃時加入；若為固體培養基，必須在培養基凝固之前（50-60℃）加入，振蕩使溶液與其他成分混合均勻。
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