1、銅礦石的微生物浸出 
   細菌浸銅工藝分地面廢石堆浸和地下就地浸出。堆浸用于處理傳統選冶技術難以處理的低品位礦、廢礦、尾礦和表外礦，地下就地浸出用于品位高但無法采至地面的礦石。 
   黃銅礦是最主要的銅礦物，屬四方晶系礦物，其晶格能比常見硫化物高很多，故較難浸出。 
   目前大多采用萃取一電積技術從浸出液中提取銅，微生物浸銅技術的成功提高了生物冶金的競爭力。
2、鈾礦石的微生物浸出 
   細菌浸鈾工藝主要采用地下就地浸出，其次還有堆浸和槽浸，其對象為低品位鈾礦石和地下不能采出的富鈾礦石。鈾的微生物浸出主要為間接氧化作用，在硫酸、硫酸高鐵或硫桿菌屬細菌存在下，不溶性四價鈾轉變成可溶性的六價鈾，Fe2+是鈾礦氧化反應的電子傳遞者.浸出得到含鈾溶液后用離子交換吸附或溶劑萃取的方法提取鈾。
3、難處理金礦的生物氧化預處理 
   金礦資源中有1/3屬于用傳統氰化法難于提取的“難處理”金礦 。這類礦可分為3類： 
（1）含金硫化礦 
    金具有親硫和親鐵的雙重性質，故常常與硫化礦物共生，黃鐵礦和砷黃鐵礦（毒砂）是常見的載金礦物。金常以固溶體或次顯微形態包裹在其中。直接氰化浸出時，包裹金無法與浸出劑直接接觸。 
（2）碳質金礦 
    金被碳質物包裹或與碳質物形成穩定配合物，阻礙用傳統氰化法回收金。 
（3）黏土型金礦 
     細菌氧化能破壞金的包裹體釋放出金，是難處理金礦預處理的有效手段。以含金砷黃鐵礦的細菌氧化預處理為例，常用菌種為硫桿菌屬，采用槽浸工藝。
    溶于浸出液中的三價砷比五價砷毒性要大，故處理含砷礦石的工藝流程須考慮以生態環境可以接受的形式排放固態或液態的含砷廢物。對浸出液中砷的穩定存在形式目前尚存不同觀點，表明微生物氧化預處理含砷金礦的原理還有待進一步研究。

 

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