生物修復（bioremediation）是近年來出現的一個新名詞。它是指用生物的方法修復被人類長期的??生產和生活活動所污染和破壞的局部環境，使之重現生機的過程。這類局部被破壞的環境很多，如：廢棄的工廠和軍事基地、地下水、加油站附近的土壤、原油泄漏造成的海洋及海濱污染等。這些受到嚴重污染的地區往往已經不適合于普通生物的生存，因此需要采用特殊的生物和特殊的方法予以處理。常用的生物修復方法有??植物生物修復與微生物生物修復兩類。

  對于受污染的土壤，如果能找到在這種環境中生存的植物，植物根系就能夠將污染物逐步分解或積累在植物組織中。這一方法對于受原油及其制品污染的土壤特別有用，已經發現了一些耐油的植物品種，它們的根系能夠將污染物分解、轉化。有些植物還能在受到重金屬嚴重污染的土壤上生長，并將重金屬離子逐步富集到植物的軀干和枝葉。我國對大量的鹽堿地采用種植耐鹽堿植物??，逐步改造成良田，是利用植物進行生物修復的成功例子。

  微生物生物修復是研究得最多的方法。由于微生物種類繁多，適應環境的能力強，而且能夠誘導產生代謝特殊污染物的酶系，因此總是能夠找到合適的微生物并利用它們對被污染的局部環境進行修復。理想的生物修復應??該使環境中的有毒有機化合物在微生物的作用下徹底礦化為二氧化碳和水。好氧及厭氧微生物都能用于生物修復，但由于環境是一個開放體系，很難做到厭氧，一般更傾向于應用好氧微生物。

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