真核細胞基因表達調控要比原核細胞基因復雜得多，用于??真核細胞的克隆和表達載體也不同于原核細胞。目前所用的真核載體大多是所謂的穿梭載體（shuttle vector），這種載體既能在原核細胞中復制擴增，也可以在相應的真核細胞中擴增及表達。由于在原核體系中易于進行?基因的復制、擴增、測序等，因此可以利用穿梭載體先將要表達的基因裝配好并大量復制后再轉移到真核細胞中去表達，這為真核細胞基因工程操作提供了很大的方便。

  用于真核生物基因表達的載體應具備如下條件：

  ① 含有原核基因的復制起始序列以及篩選標記，以便于在E.coli細胞中進行擴增和篩選；

  ② 含有真核基因的復制起始序列以及真核細胞篩選標記；

  ③ 含有有效的啟動子序列，保證其下游的外源基因能啟動有效的轉錄；

  ④ 應包含 RNA聚合酶Ⅱ所需的轉錄終止序列和poly(A)加入的信號序列；

  ⑤ 具有合適的供外源基因插入的限制性內切酶位點。

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