與初級代謝產物的生物合成一樣，抗生素的合成也受到酶合成的阻遏和酶活力的抑制等調節和控制。同時抗生素等次級代謝產物又是微生物分化階段的產物，因此凡是調節和控制分化過程的因素都會對抗生素的生??物合成產生影響，分化時的??一些現象，如孢子形成和氣生菌絲的產生等都會影響抗生素的產量。

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