除了上面討論的能夠生產抗生素的主要微生物種屬外，其他微生物也能夠產生一些重要的抗生素。在細菌中，從葡萄糖桿菌Gluconobacter SQ26445分離得到了磺胺凈素（Su?lfazecin），屬干磺酰基單環β內酰胺類抗生素。以后發現農桿菌（Agrobacterium）、色桿菌（Chromobacterium）、纖維黏細菌（Cytophage）和曲撓桿菌（Flexibacter）的一些種也能產生磺胺凈素。黃桿菌（Flavobacterium）和黃單胞菌（Zanthomonas）的某些菌株則能夠產生頭孢菌素C。

  霉菌中的頭孢霉（Cephalosporium chrysogenum）是最重要的頭孢類抗生素生產菌種。頭孢霉在分類學上有一些不同看法，它們的共同特點是分生孢子的結構簡單，在一小部分分生孢子的頂上有一個單莖或??分枝很少的莖，其菌絲分化形成節孢子。Cephalosporium chrysogenum的營養要求與青霉類似，一些糖類、甲基油酸或甘油都能作為碳源，無機氮、氨基酸或復合的多肽作為氮源。除頭孢類抗生素外，Cephalosporium生產的其他重要抗生素都屬于聚酮類或萜類化合物，如六酮類的淺藍菌素Cerulenin（C.caerulens）是脂肪酸生物合成的抑制劑；梭鏈孢酸（Fusidic acid，Acremonium fusidioides）則是抗葡萄球菌劑。

  木霉屬的Trichoderma inflatum是環孢A的生產菌，環孢A具有抗霉菌活性，更重要的?用途是作為器官移植的免疫抑制劑。

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